Para minha referência futura e talvez ajudar mais alguém...
rsync -P --rsh=ssh nome-arquivo.tar.gz usuario@host:~/caminho/destinho/
Com este comando é possível continuar um upload ou download iniciado por scp, mas que por alguma razão foi interrompido.
O -P é equivalente a --partial (continuar transferências parciais) e --progress (exibe uma barra de progresso) e --rsh=ssh faz com que o rsync use o ssh (assim como o scp) para fazer a transferência de forma segura.